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Transcriptome Sequencing
Introdução

dot A sequenciação do Transcriptoma utiliza a sequenciação Next Generation sendo um método rápido e confiável para a recolha
   de informação genômica. A Macrogen fornece a análise total da expressão de mRNA transcrito, que permitem: a
   descoberta do gene Novel; a identificação de novos SNPs e InDels; identificar a variação do Novel Splice; a descoberta de
   rearranjo cromossómico; a identificação de microRNAs e UTRs.

Plataforma de Sequenciamento

dotGS-FLX Titanium / Plus
dotHiSeq2000 / Sistema MiSeq (Single, Paired-end)

Análise de Dados*

Dados de expressão génica

dotPerfis de expressão quantitativa
dotAnálise de ontologia génica

De novo sequenciamento

dotAnálise de dados padrão
  - Montagem de estatísticas De novo
  - Perfil de expressão gênica
  - Genes expressos diferencialmente (DEGs)

dotAnálise avançada de dados
  - Anotação do Gene/análise de grupo de gene
  - Análise comparativa

Resequencição

dot Análise de dados padrão
  - Mapeamento estatístico
  - Perfil de expressão génica
  - Chamadas SNPs e InDels pela referência do mapeamento do genoma

dotAnálise avançada de dados.
  - Gene de fusão, análise personalizada

* Análise de dados pode variar, dependendo da disponibilidade de referência e do tipo de plataforma

Technology pipeline for de novo Transcriptome Sequencing

Technology pipeline for de novo Transcriptome Sequencing

Technology pipeline for Transcriptome Resequencing

Technology pipeline for Transcriptome Resequencing

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