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Whole Genome Sequencing
Introdução

dotAnaliza a sequenciação do genoma inteiro de animais e plantas ou microorganismos sem sequência conhecida até o presente
   momento.
dotAnaliza a sequenciação do genoma inteiro de organismos com sequência referenciada e fornece informações como o SNP,
   InDel, Variação de estrutura, CNV, etc.

Plataforma de Sequenciamento

dotGS-FLX Titanium / Plus
dotHiSeq2000 / Sistema MiSeq (Single, Paired-end)

Análise de Dados*

Sequenciação De novo

dotAnálise de dados padrão
   - Sequência de consenso reunida em contigs
dotAnálise avançada de dados
   - Previsão de gene
   - Anotação de gene

Resequenciamento

dot Análise de dados padrão
   - Mapeamento para o atual genoma de referência de plantas
   - Análise das estatísticas de mapeamento
   - Chamando SNPs e InDels
   - Lista de variantes em formato texto/Excel

dotAnálise avançada de dados
   - Anotação variante: SNPs e InDels são mapeados nas versões actuais do SNV e outros lançamentos relacionados ao genoma
   - Anotações funcionais: genética, estrutura genética, mudança de aminoácidos e cross-mapeamento para bancos de dados
      públicos
   - Estão disponíveis várias opções para o mapeamento de algoritmos: algoritmos de detecção de variantes, anotações,
      mapeamento de bases de dados públicas, análise de grupo e análise de caso-controle

* Análise de dados pode variar, dependendo da disponibilidade de referência e do tipo de plataforma

Technology pipeline for Whole Genome de novo Sequencing

Technology pipeline for Whole Genome de novo Sequencing

Technology pipeline for Whole Genome Resequencing

Technology pipeline for Whole Genome Resequencing

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