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Whole Genome Sequencing
Introduction

dotLe Séquençage de novo est généralement effectuée sans connaissance préalable des données de séquençage. Le Séquençage
   de novo a fait ses preuves et confirmé et developpé les résultats de recherches de bases de données, offrant d'excellentes
   ressources pour la compréhension de l'espèce.
dotCertaines informations plus cruciales, obtenues par remise en ordre de l'ADN du génome d'un organisme, sont les variations
  individuelles dans le génome, comme polymorphisme de nucléotide simple (SNP), copie variations du nombre de copies (CNV), et
  les variations structurelles.

Plateforme de séquençage

dotGS-FLX Titanium / Plus (Shotgun Matepair)
dotHiSeq2000 / système MiSeq (Jumelage-end, Matepair)

Analyse des données *

Séquençage de novo

dotAnalyse des données standard
  - Séquence consensus assemblés en contigs
dotAnalyse des données avancée
  - Prédiction de gènes
  - Annotation des gènes

Reséquençage

dotAnalyse des données standard
  - Cartographie du génome de courant de référence de l'usine
  - Analyse des statistiques de cartographie
  - SNPs et indels appel
  - Liste des variantes dans le texte / Excel formats

dotAanalyse des données avancée
  - Annotation Variante: SNPs et indels sont mappés à l' les versions actuelles de rejets de génomique SNV et connexes
  - Annotations fonctionnelles: Gene, la structure des gènes, le changement de acides aminés et de cross-mapping de bases de
   données publiques
  - Variété d'options pour les algorithmes de cartographie, les algorithmes de détection de variants, les annotations, la cartographie
   des bases de données publiques, analyse de groupe et analyse de cas-témoins sont disponibles

* L' Analyse des données peut varier en fonction de la disponibilité des références et du type de plate-forme.

Technology pipeline for Whole Genome de novo Sequencing

Technology pipeline for Whole Genome de novo Sequencing

Technology pipeline for Whole Genome Resequencing

Technology pipeline for Whole Genome Resequencing

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